正德16年6月17日。
朱厚熜下旨，让督察院左都御史石珤负责此案。看看王邦奇弹劾杨廷和的事情，是否属于诬陷，又或者弹劾的事情是真的，要求督察院清查。
6月18日，仅仅一天之后督察院左都御史石珤上疏调查结果。
王邦奇等人，俱是此次清理冗员当中，被裁汰或者是降级的锦衣卫。这些人不忿自己被裁汰，或者降级，因此污蔑内阁首辅杨廷和。弹劾的所有内容，全部都是诬陷。
其实说白了就是，一群其软怕恶之徒。
开始的时候，被裁汰，他们也不敢说什么。毕竟这是杨廷和一手主导的，石珤这个左都御史亲自清理的，他们这些小人物也不敢和杨廷和对抗。但听到朱厚熜批驳廷推之后，外面到处都传朱厚熜不满杨廷和，准备清理前朝首辅杨廷和的消息。消息是越传越广，而且越传越像是那么一回事情。
都表示朱厚熜这个新皇不满正德朝老臣，特别是不满杨廷和。
因此他们这些人就装着胆子，弹劾了杨廷和。
当然事情也没有这么简单。是因为现在清理冗员和清查庄田，已经开始涉及到权贵利益，得罪人无数。这些人想要看看朱厚熜的态度，也想试探一下朱厚熜是不是真的想要处理杨廷和。
所以找了这些人作为旗子，弹劾了杨廷和。在这里面使劲的，有勋贵，有外戚，还有一些失势的内官。他们都在这里面兴风作浪。
最后参与弹劾的就变成了十来个人。
石珤在最后表示，此等奸佞之徒，除了吃国家财政，对于朝廷没有任何的用处。是朝廷绝对的蛀虫。要求朱厚熜严惩这些人。而且要求朱厚熜再次清查锦衣卫衙门，看看锦衣卫这边到底有多少这样只知道领钱，却不干活，还在影响国家政策的混账东西。
只要皇帝同意，石珤愿意再次清查锦衣卫荫封的问题，以及旗校泛滥的问题。石珤其实已经奉命清理过一次锦衣卫，但主要是清理了工匠泛滥的问题，以及旗校冒领的问题。主要是锦衣卫有不少旗校名单，但其实没有这个人，也就是说都是吃空饷的。
说是锦衣卫，其实也包括东厂。
因为东厂指挥的一些人当中，也有大批都是世袭锦衣卫。只不过拨给了东厂，成为了东厂的人。都在石珤清理范围之内。不管是东厂还是锦衣卫，吃空饷的情况非常严重。石珤把这些空饷名额，全都清理出去。
但还没来得及大规模解决那些荫封的锦衣卫。
现在石珤要的就是这个。
光是清理工匠，还有旗校冒领的问题怎么够。大明朝成立至今，皇帝不知道荫封多少世袭锦衣卫。不要说是世袭的普通锦衣卫旗校，就是往上百户、千户也有一大堆。甚至往上还有一大堆的指挥同知、指挥使这样的世袭官位。皇帝高兴的时候，荫封一些几岁的孩子为世袭锦衣卫指挥使，都是非常普遍。
为什么明朝中后期开始，锦衣卫指挥使身上都要有后军都督府的职位。就是因为荫封的锦衣卫指挥使太多，光是一个锦衣卫指挥使，在锦衣卫不是官位最高的。
这些荫封的锦衣卫，和卫所的世袭锦衣卫不一样。卫所的世袭锦衣卫，他们是需要到锦衣卫干活的，也就是说他们是锦衣卫后备役。但荫封的世袭锦衣卫，那都是不干事光拿朝廷薪水的。对于他们来说，世袭锦衣卫职位，就和大明朝的爵位一样。从开国开始积累到现在，荫封世袭锦衣卫非常多。这样的人比干活的锦衣卫人数还要多。石珤是请求朱厚熜，把这些人统统处理掉。
这个真是石破天惊。
因为这个世袭锦衣卫职位和爵位一样，都是朝廷奖赏功臣后人的。你要是清理这些人，那么怎么都说不过去。毕竟这都是他们的祖辈用功劳争夺的。
但清理了，对于朝廷绝对是好事情，不知道每年都能节省多少钱。
不过这个不能是朱厚熜这个皇帝说出来，因此批示：交由内阁讨论。等内阁讨论之后，票拟要清查荫封的世袭锦衣卫职位，朱厚熜再批示同意，那么可以减轻自己这边的压力。所有的压力会转移到内阁那边。
那么多的荫封的世袭锦衣卫朱厚熜管不了，但对于王邦奇他们直接批示，全都抓进去。继续调查，看看他们背后有没有更大的主谋。
这是朱厚熜给杨廷和的台阶。
看看皇帝都已经把王邦奇他们抓了，杨廷和你该表态了。
6月19日，杨廷和上了一份奏折。
在奏折当中，杨廷和辩解，表示自己非欺皇上年幼，也非是逼宫。只是一时未能接受弹劾当中的指责，所以才闭门思过。经过这些天的反思，杨廷和已经明白，此次事情自己的不冷静，带给朝廷的混乱，辜负了皇帝的信任。对于这一点杨廷和感到深深地歉意，感到深深地愧疚。已经明白这一次的事情，自己有很多做错的地方。
杨廷和在奏折最后当中，请求皇帝宽恕自己的任性之举。
朱厚熜在这封奏折上，直接表态，自己理解杨廷和的委屈。表示杨廷和乃大明朝的功臣，是先帝驾崩之后力挽狂澜的功臣，更是朱厚熜的功臣。现在的大明朝需要杨廷和，朱厚熜也需要杨廷和。
朱厚熜绝对不允许任何人污蔑杨廷和这位立下大功劳的首辅。
正德16年6月20日，杨廷和回到了内阁值班。随着杨廷和回来，写过辞职信、说自己有病趟家里的，都回来上班。大家都知道这一次的政治危机应该是过去了。
正德16年6月21日，朱厚熜召开了廷议。
“因臣之事，耽误朝廷大事，臣罪莫大焉。请皇上处罚。”
杨廷和立马是检讨。
廷议开始之后，杨廷和上前跪下，跟朱厚熜和朝臣检讨。认为都是自己任性的错，希望皇上能够处罚自己。朱厚熜立马道：“杨卿，此事不怪卿，是有人中伤于你。然卿也有过。卿乃内阁首辅，岂能因为这样的事情，就闭门谢客这么长时间。你这是辜负朕的期望，辜负朝廷的期望。”
“臣有罪。”
杨廷和态度很好。
从参加廷议开始，就一直是认错。
虽然是朱厚熜和杨廷和互相妥协，但杨廷和该做的姿态是要做出来的。这一次杨廷和是另类的逼宫，现在拿到了自己想要的东西，就必须要给皇上一个面子。杨廷和心中再怎么看不起朱厚熜这个小皇帝，朱厚熜也是一个皇帝。既然是皇帝，就要有皇帝的体面，一定要给皇帝台阶下。
这方面杨廷和是老滑头。
本身就出自官宦世家，而且四十年的政坛生涯，对于这些他都非常熟悉。而且杨廷和这几天也受到了很多弹劾，不少言官都认为杨廷和这是在欺皇帝年幼。弹劾杨廷和这是在逼宫，是一个权臣干的事情。杨廷和受到如此多的弹劾，这些年下来绝对是第一次。
权臣，在明朝权臣是受到唾弃的。
那些言官可是看不得明朝出现权臣。就算那个人是他们比较信服的杨廷和也不行。所以这几天言官是非常活跃的，他们都弹劾杨廷和是在逼宫。
名正言顺。
名不正则言不顺。
杨廷和现在就是如此。他本来和言官关系很好，很多言官都信服杨廷和，之前都支持杨廷和的政策。因此他们愿意和杨廷和合作，弹劾那些权贵。可是这一次不一样，杨廷和这一次逼宫，却让不少中立的言官，都参与了弹劾杨廷和的行列当中。这是朱厚熜登基之后，第一次有这么多的言官参与弹劾杨廷和。
这就是掌握大势的优势。
历史上嘉靖皇帝刚刚登基，就掀起了大礼仪之争，和这些言官直接站在了对立面。当时所有的言官都认为嘉靖皇帝这样不对，所以都在反对嘉靖皇帝。甚至因为大礼仪之争，很多言官在其他事情上对于嘉靖皇帝的选择也是非常苛刻。总是认为嘉靖皇帝太胡闹，要好好地审查嘉靖皇帝要做的事情。
结果是嘉靖看来自己简直是举世皆敌，根本找不到支持自己的。心中觉得杨廷和真是一个权臣，竟然朝廷这么多人都是他的人。所以对于杨廷和，以及支持杨廷和的人是咬牙切齿。
这就是一种认识上的误差。
现在情况就有很多变化。此次杨廷和逼宫整体上的确是很成功，但同时也让杨廷和的名誉受到了很大的打击。很多中立的言官，开始觉得杨廷和不对。这是一种无形的名誉打击。
杨廷和也是感受到了。
但杨廷和不认为自己错了。
周公恐惧流言日，王莽谦恭未篡时。 向使当初身便死，一生真伪复谁知？这些今天抨击自己的言官，以后一定会明白自己是正确的。
“罚俸半年。”
“臣谢皇上宽恕。”
杨廷和跪着再次感谢朱厚熜。
随着杨廷和认错，朱厚熜对他罚俸半年，此次维持十多天的政治危机正式结束。当然表面上结束，毕竟这样的事情出来，皇帝心中肯定是有疙瘩的。
“此时已过，往后谁也不许再提。杨卿，讨论正事。”