王琼重新出山，最大的阻力是杨廷和。
当朱厚熜给杨廷和一个承诺，绝对不会让王琼入京之后，杨廷和也是让了一步，同意王琼出山。有了杨廷和的同意，事情就简单很多。嘉靖二年六月六日，廷议当中正式选出三名钦差。
朱厚熜任命王琼为右都御史，总制闽浙两省军务。任命户部左侍郎吴廷举为钦差大臣，清查此次事情当中市舶司的问题。迁原右佥都御史、宁夏巡抚张润为督察院右副都御史，也成为了钦差大臣的一员，跟随王琼和吴廷举一起去浙江。
钦差队伍，王琼为主，吴廷举和张润为副。
且分工明确。
王琼的任务是调查争贡之役当中宁绍两地卫所的问题，整顿闽浙两省的卫所。而吴廷举的目标是市舶司，张润才是要审案子的。这个年代交通不发达，因此很多事情朝廷无法在第一时间派人过去。
就像是争贡之役。
虽然发生了有段时间，但朝廷不可能反应那么快。等朝廷准备好派人过去，那都是一两个月之后的事情。所以一般发生这样的事情，都是先交给当地官员处理，稳定当地的情况。因此朱厚熜并不是很着急。
“罪臣王琼参见皇上，吾皇万岁万岁万万岁。”
嘉靖二年六月二十一日，王琼终于从太原老家来到了京城。
不敢有丝毫的休息。
来到京城第一时间，沐浴更衣之后，就来到了乾清宫。见到了朱厚熜之后，立马是大礼参拜。因为这是王琼第一次见到朱厚熜。
王琼早在朱厚熜登基之前，就被杨廷和下了监狱，羁押在督察院当中。朱厚熜登基之后，更是很快削职为民，因此朱厚熜是没有见过王琼的。今天看到王琼，发现王琼长得很是富态。看起来这两年王琼过得还可以。
朱厚熜早年就听闻王琼是大佬人物，脾气甚大。
杨廷和他们决定朱厚熜为嗣皇帝，已经汇报了张太后，得到了张太后支持的情况之下，王琼还上前质问杨廷和他们。认为没有自己这个吏部尚书的参与，杨廷和他们没有权力决定嗣皇帝。
闹得非常厉害。
王琼以往做事情很果断，丝毫不拖泥带水。而且王琼此人能力非常强大，管理漕运的时候编著了“漕河图志”。后来管理漕运的人，都是根据这本书管理漕运，因为漕运很多事情和这本书记载的丝毫不差。这也是王琼能够名震朝野的原因。后来王琼担任户部尚书、兵部尚书的时候，对于自己的工作更是了如指掌。
担任户部尚书的时候，任何部门要钱，王琼都能够一针见血的指出来，他们还有多少钱，做某些事情大约需要多少钱。包括军方要钱粮的时候，王琼根本不用查找内容，很直接的表示某仓库、某草场还有多少粮草，各郡每年运送多少，边防士卒每年秋收粮草多少。说的这些军方大佬都是哑口无言。
到了兵部尚书的时候，王琼的才干更加明显。
不管是碰到蒙古部落侵犯边境，还是国内发生暴民骚乱，王琼都是镇定自若的排兵布阵，丝毫不会惊慌失措。王琼这种能力，都让很多人信服。
因此朱厚熜一直以来王琼此人应该是一个很锐利的样子，没想到今天看到的王琼却是胖嘟嘟的样子，非常的富态，就像是乡下地主一样。丝毫看不出他以前是如何的镇住那些军方大将，如何名震朝野的。
“免礼。”
“谢皇上。”
王琼缓慢的站了起来。
并没有抬头看，而是低着头。朱厚熜颇为担心，难道王琼削职为民这两年，真的已经失去了当年的威风。如果王琼真的没有了当年那种锐利，朱厚熜就不需要王琼了。朱厚熜需要的是，当年敢于和杨廷和对峙，镇定自若的处理大事情的王琼。
因此朱厚熜道：“王琼，朕久闻你的大名。很多人都跟朕说，你乃大才，说你文武双全。”
“都是谬赞。”
“王琼，朕希望不是谬赞。若真是传闻有误，朕就不能把总制闽浙军务这个重要职务交给你。”
“臣定当竭尽全力。”
“清查闽浙两省卫所，可有一些想法？”
朱厚熜轻轻地问了王琼。
王琼很冷静的道：“不知陛下想如何整顿两省卫所。”
“朕想要能打仗的兵，而且朕不希望提供军队粮食的军屯被某些人侵占。”
“皇上，若要打仗的兵，想要解决卫所军屯问题，需要废除卫所制度呢？”
王琼突然抬头。
直接问朱厚熜。朱厚熜较有兴趣的看着王琼。从王琼进入乾清宫开始，王琼的样子就一直是富态的，一种得过且过的样子。但王琼突然问朱厚熜这个问题，却让朱厚熜感受到了王琼的大胆。
王琼的眼睛还有光。
让朱厚熜明白，王琼还没死。
因此朱厚熜也没有藏着掖着，很直接的对王琼道：“朕只要能打仗的兵，如果卫所的存在，妨碍军队的战斗力，那么朕不会反对废除卫所制度。”
王琼很是惊讶。
虽然王琼也听过小皇帝的事情，知道小皇帝登基之后，很快就稳定了自己的皇位。知道这个小皇帝手段惊人，但小皇帝到底怎么想的，王琼还是不怎么清楚的。
目前朝廷推行的新政，是杨廷和主导的。王琼虽然不喜欢杨廷和，但对于杨廷和的能力还是信服的。因此杨廷和主导新政，王琼是相信的。王琼只是不清楚，杨廷和主导的新政当中，小皇帝扮演的是什么角色。
但刚刚听到朱厚熜的话，王琼心中是非常吃惊的。
卫所制度？
这可是大明朝军队根本制度，是朱元璋当年制定的。整个大明朝的军队运转，都是以卫所制度为基础。就算后来文官压制了勋贵，文官开始影响大明朝的军队发展。但卫所制度依旧是大明朝军队最根本的体系。
随着卫所制度的崩溃，为了组建战斗力强大的军队，大明朝也开始进行募兵。但大明朝的那些皇帝，哪一个敢说要废除卫所制度？
朱元璋专门写了“皇明祖训”，告诉后代皇帝，一定要遵循自己制定的规矩。因此大明朝的皇帝，虽然对于大明朝都进行了一些改变，但谁也没有逃脱朱元璋制定的框架当中。谁也不敢改变朱元璋制定的，最基础最根本的东西。
显然卫所制度就是朱元璋制定的框架当中，最基础和最根本的东西。一旦改变了卫所制度，那么就会改变大明朝现在的军事制度。
但眼前的小皇帝显然是不在意这些，真有需要是可以改变的。
这让王琼怎么可能不吃惊。
“陛下，卫所军屯问题复杂，涉及世袭军官，涉及勋贵，涉及地方官吏，牵一发而动全身。”
既然朱厚熜如此胆大，王琼也是大胆的告诉朱厚熜。
不要小看卫所问题。
“是，这些朕都知道。所以朕不是让你去闽浙两省，先试试效果如何。”
说道这里，王琼明白，朱厚熜此次让他出山，是有重要的事情交给自己。这是让自己去浙江和福建改革现在的卫所制度。这可不是容易的事情。
王琼是做过兵部尚书的，对于大明朝的军队情况非常熟悉。
改革卫所制度，哪里是那么容易的事情。
“王琼，从朕登基开始，就有很多人不停地告诉我说，王琼国士无双。卫所制度现在情况如何，朕想你比朕更清楚。你可愿为朕分忧。”